فصل گذشته بعد از اینکه استقلال به دلیل قانون سقف بودجه دچار مشکل شد، سیدحسین حسینی به عنوان کاپیتان تیم وارد زمین شد و علاوه بر اینکه بازیکنان زیادی را متقاعد کرد مبلغ قراردادشان را کاهش دهند، خودش هم به استقلال و مبلغ کم کرد. او قرارداد خود را کاهش داد تا زمینه را برای امضای قرارداد بازیکنان محروم فراهم کند (البته در نهایت امتیازهای کسر شده از پرسپولیس به دلیل بحث سقف بودجه به این تیم بازگردانده شد و این اتفاق سر و صدای زیادی به پا کرد) البته در آن زمان حسینی هیچ مصاحبه ای علیه او انجام نداد و حرفی نزد و حرفی نزد اما چندی پیش از مدیران باشگاه خواست تا با رعایت مسائل حقوقی تغییراتی در قراردادش با استقلال برای لیگ 24 ایجاد کنند. گفته می شود برخی از لیدرهای استقلال به او قول داده اند که اگر مشکل قانونی وجود نداشته باشد، اصلاحیه ای را اضافه کنند.
این روزها سران استقلال منتظر دیدار حسینی در این باره و شفاف سازی کامل وضعیت هستند. البته ابتدا باید دید کاپیتان اول استقلال در این تیم می ماند یا شرایط دیگری پیش می آید. سیدحسین حسینی یک فصل دیگر با استقلال قرارداد دارد اما یک ماه است که شایعاتی مبنی بر جدایی او به گوش می رسد.